As doenças ligadas ao sexo devem-se a alterações nos cromossomas sexuais normais do doente.
Normalmente, o complemento feminino são dois cromossomas sexuais X. Um é derivado de cada um dos progenitores e um dos pares é também inactivado aleatoriamente por um processo chamado lionização numa fase precoce do desenvolvimento.
Em contraste, um homem tem a constituição cromossómica sexual XY e, por isso, tem apenas uma cópia de cada gene ligado ao X. O cromossoma Y contém importantes determinantes masculinos.
O pedigree familiar das doenças ligadas ao sexo depende do cromossoma sexual que transporta o gene mutante e se a caraterística é dominante ou recessiva. Algumas caraterísticas autossómicas podem imitar doenças ligadas ao sexo.
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