Zu den Nebenwirkungen gehören:
- Glossitis
- Hautausschläge
- Erythema multiforme - einschließlich Stevens-Johnson-Syndrom
- epidermale Nekrolyse
- Übelkeit und Erbrechen
- Hämatologische Wirkungen aufgrund von Trimethoprim;
- Eosinophilie
- Agranulozytose
- Granulozytopenie
- megaloblastische Anämie
- Purpura
- Leukozytopenie
Das Risiko, ein Erythema multiforme, ein Stevens-Johnson-Syndrom und eine toxische epidermale Nekrolyse zu entwickeln, lag bei 1,7/100.000 Anwendern von Co-Trimoxazol (95% CI 0,7, 4,4) und bei 0,8/100.000 Anwendern von Trimethoprim (95% CI 0,2, 2,7).
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