Los defectos del sistema inmunitario y de las defensas físicas del huésped pueden causar bronquiectasias, por ejemplo:
- deficiencia primaria y secundaria de inmunoglobulinas
- deficiencia de complemento
- déficit de fagocitos
- enfermedad granulomatosa crónica
- enfermedad de Chediak-Higashi
- déficit de adherencia leucocitaria
- aspergilosis broncopulmonar alérgica
- postrasplante pulmonar
- síndrome de cilios inmóviles
- síndrome de Kartagener
- síndrome de Young
- fibrosis quística
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