Las glándulas salivales y lagrimales se infiltran con linfocitos y los acinos se destruyen progresivamente. La mayoría de los linfocitos son células T con predominio de células T ayudantes inductoras (CD4).
El epitelio de los conductos se vuelve hiperplásico, formando cilindros dentro del lumen y obstruyendo los conductos más pequeños. La metaplasia de las glándulas mucosas del epitelio de los conductos puede dar lugar a una saliva gelatinosa en algunos pacientes. Las estenosis, las dilataciones de los conductos y la infección ascendente complican el cuadro.
Hiperactividad de los linfocitos B: los autoanticuerpos circulantes son característicos del síndrome de Sjogren. Los anticuerpos se dirigen contra antígenos no específicos de órganos, como inmunoglobulinas (factores reumatoides) y ribonucleoproteína citoplasmática pequeña (anti-Ro y anti-La). Estos autoanticuerpos no parecen tener un papel patogénico.
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