La antitrombina es un inhibidor de la serina proteasa que inhibe los siguientes factores de coagulación
La unión de la heparina a la antitrombina mejora la velocidad con la que la antitrombina puede neutralizar estos factores protrombóticos. In vivo, los glicosaminoglicanos de las células endoteliales sirven de catalizadores endógenos para la activación de la antitrombina.
La deficiencia de antitrombina es una causa de trombofilia.
El cofactor II de la heparina es un inhibidor distinto de la proteasa de serina que inhibe la trombina en presencia de heparina. La deficiencia del cofactor II de la heparina puede causar trombofilia.
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