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Las células del sistema conductor del corazón se originan a partir de la modificación de células mesenquimales. El nódulo sinuatrial deriva de células del seno venoso. A medida que éste es absorbido por la aurícula derecha, la región del nódulo pasa a situarse en la unión del seno venoso y la aurícula original. En el corazón maduro, se encuentra en un punto del seno venoso próximo a la apertura de la vena cava superior.
Algunas de las células del nódulo auriculoventricular y del haz de His también se originan en el seno venoso primitivo hacia su lado izquierdo; otras se originan en el canal auriculoventricular. Finalmente, ambos grupos migran a una posición dentro del tabique interauricular.
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