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Se absorben los aminoácidos, no las proteínas; las proteínas dependen de la digestión previa de los aminoácidos. La mayor parte de la absorción de aminoácidos se produce en el yeyuno; la contribución del íleon es menor.
Los aminoácidos se absorben mediante un mecanismo de cotransporte con iones de sodio. Tanto el ion sodio como el aminoácido se combinan con un receptor proteico de la superficie celular. Existen diferentes receptores para los grupos
Además, algunos aminoácidos pueden tener su propio transportador específico, como la prolina. El receptor transporta ambas moléculas al interior de la célula. La energía para este transporte procede del gradiente de concentración de sodio a través de la membrana celular. Los transportadores Na-K ATPasa bombean iones de sodio de forma activa y continua hacia el exterior para mantener el gradiente.
Tras su absorción en un enterocito, los aminoácidos pueden tener uno de estos dos destinos
El movimiento del sodio hacia el interior de la célula va acompañado del movimiento del cloruro y del agua hacia el espacio intercelular y, finalmente, hacia el torrente sanguíneo.
Puede haber una pequeña absorción de aminoácidos en forma de dipéptidos y tripéptidos. Éstos probablemente se digieren dentro de la célula a aminoácidos.
Los defectos del transportador proteico de aminoácidos pueden provocar afecciones como la enfermedad de Hartnup y la cistinuria.
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