L'endoscopie est une procédure qui permet de visualiser directement des parties du tractus gastro-intestinal et, le cas échéant, d'entreprendre des manœuvres thérapeutiques. L'endoscope est l'instrument nécessaire ; les endoscopes rigides ne sont généralement pas utilisés aujourd'hui, sauf pour la sigmoïdoscopie.
L'examen de l'œsophage, de l'estomac et du duodénum proximal peut être réalisé à l'aide d'un gastroscope sous sédation légère.
Une cholangiopancréatographie rétrograde endoscopique (CPRE) permet de visualiser le pancréas et l'arbre biliaire.
Un coloscope permet d'examiner le gros intestin et l'iléon terminal. Cependant, l'ensemble du gros intestin ne peut être examiné que chez 85 à 90 % des sujets.
Un sigmoïdoscope permet de visualiser le rectum. Un sigmoïdoscope flexible permet de visualiser le côlon sigmoïde et le côlon descendant.
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