La régulation de la glycogène synthase hépatique doit être envisagée en termes de structure et de fonction :
Par conséquent, la glycogène synthase est stimulée par des agents qui réduisent la concentration d'AMPc, comme l'insuline, et inhibée par des agents qui augmentent les niveaux d'AMPc, comme le glucagon et l'adrénaline.
De même, une proportion accrue de l'enzyme glycogène phosphorylase sous la forme active a, comme cela se produit en présence d'une concentration réduite de glucose cellulaire, réduit l'activité de la glycogène synthase.
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