La principale complication est l'hypothyroïdie, observée chez 80 % des patients dans les 20 ans suivant la première administration d'iode radioactif.
Les effets à court terme sont mineurs mais peuvent inclure une douleur transitoire au niveau du cou ou une crise thyrotoxique chez les personnes âgées.
L'iode radioactif est contre-indiqué pendant la grossesse, car il abrase la thyroïde du fœtus, ce qui entraîne un crétinisme et un retard mental. La patiente ne doit pas être enceinte au moment du traitement et ne doit pas le devenir dans les 4 mois qui suivent.
Les effets à long terme sont décrits dans le menu.
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