La thiamine, sous sa forme active de pyrophosphate de thiamine, agit comme cofacteur pour trois enzymes impliquées dans le métabolisme des hydrates de carbone :
Par conséquent, la carence tend à affecter les organes dépendant des carboyhdrates, tels que le SNC, le foie, le cœur et les muscles squelettiques.
Les réserves corporelles de thiamine sont faibles, de sorte qu'un état de carence apparaît rapidement si l'apport alimentaire est inadéquat.
La thiamine étant omniprésente, une carence n'apparaît que dans les circonstances suivantes :
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