La majorité des infections des voies respiratoires supérieures sont dues à des picornavirus du groupe des rhinovirus. Cependant, d'autres virus tels que les adénovirus, les coronavirus, les virus de la coxsachie, les échovirus, les virus de la grippe, les virus parainfluenza et le virus respiratoire syncytial (VRS) peuvent être à l'origine d'infections des voies respiratoires supérieures.
Le VRS, les virus de la grippe, les virus parainfluenza I et II et les adénovirus peuvent également provoquer une infection aiguë du larynx, de la trachée et des bronches principales.
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