Existem três genes no VIH que são caraterísticos de todos os retrovírus:
- gag:
- codifica uma proteína precursora (Pr55)
- produz a clivagem:
- proteína matriz p17
- proteína do capsídeo p24
- proteína do nucleocapsídeo p9
- p6
- pol codifica as actividades de transcriptase reversa, endonuclease e protease
- env:
- codifica uma proteína precursora p160
- rendimentos da clivagem:
- p41 uma proteína transmembranar que ancora p120
- p120 liga-se de forma não covalente a p41 e actua como recetor CD4
Para além destes genes típicos, existem outros genes reguladores.
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