As causas da amenorreia primária e secundária sobrepõem-se, mas a distinção é informativa. A amenorreia secundária indica um trato genital inferior patente, um endométrio que respondeu às hormonas ováricas e ovários que responderam às gonadotrofinas. As excepções incluem cirurgia ao endométrio ou ao colo do útero, que raramente causam aderências intra-uterinas ou estenose cervical, respetivamente.
As doenças congénitas apresentam-se normalmente como amenorreia primária, por exemplo
- malformações congénitas do trato genital
- feminização dos testículos
- disgenesia gonadal
- hiperplasia suprarrenal congénita
- hipogonadismo hipogonadotrófico
No entanto, qualquer causa de amenorreia secundária pode apresentar-se como amenorreia primária se ocorrer antes dos 16 anos de idade.
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