Um cílio, plural cílios, é uma projeção em forma de dedo da superfície de células especialmente adaptadas. Encontram-se em grande número nas células epiteliais do trato respiratório e do trato genital feminino, onde funcionam para mover partículas ao longo da superfície da célula.
Em secção transversal, um cílio está ligado à membrana e contém um cilindro composto por 9 pares de microtúbulos; cada par é constituído por 2 microtúbulos fundidos. No centro deste cilindro encontram-se 2 microtúbulos que não se associam entre si. A disposição 9+2 dos microtúbulos vai da ponta do cílio até a base. Na base, apenas os microtúbulos externos se unem a um centríolo modificado denominado corpo basal. O corpo basal governa a formação dos cílios no início da vida da célula - os centríolos dividem-se e fornecem um centro organizador para a montagem dos microtúbulos sob a membrana celular.
Um de cada membro de um par tem processos de ligação a um par adjacente. Estes processos contêm uma proteína, a dineína, e atividade ATPase. A degradação do ATP no local resulta na deslocação de um microtúbulo em relação aos seus vizinhos. O efeito global para o cílio de numerosas interações deste tipo por segundo é um movimento de oscilação que é cíclico. O ciclo tem uma fase em que o cílio é relativamente reto e empurra a matéria superficial, seguida de uma fase de curvatura durante o regresso à sua posição inicial, quando a matéria superficial não é impulsionada.
Devido às interações locais da membrana, o ciclo de oscilação é ligeiramente desfasado entre cílios adjacentes num plano ao longo da superfície celular. Isto resulta num movimento de varrimento coordenado que é mais eficiente na orientação de partículas, como o muco na árvore respiratória, ao longo da superfície celular.
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