A vagotomia selectiva é um meio operatório de reduzir a produção de ácido gástrico. As fibras vagais que passam para o estômago são divididas, enquanto as fibras que passam para e das vísceras abdominais são preservadas. Esta técnica é particularmente indicada quando é necessário recorrer à drenagem gástrica, por exemplo, em caso de estenose pilórica, úlceras duodenais estenosantes ou hemorrágicas.
A incidência de complicações, como a diarreia grave, é menor do que a da vagotomia troncular, mas a taxa de recorrência de úlceras é mais elevada.
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