Uma vagotomia troncular envolve a divisão dos troncos vagais anterior e posterior perto do esófago abdominal e logo abaixo do diafragma. Esta operação é muito bem sucedida na redução da secreção ácida e, por conseguinte, promove a cicatrização da úlcera.
No entanto, a permeabilidade do esfíncter pilórico depende do tónus vagal e, por isso, a desnervação por si só pode levar a uma obstrução funcional do trato de saída. Assim, é utilizado um procedimento de drenagem ao mesmo tempo que a vagotomia troncular para incentivar o esvaziamento, por exemplo, uma piloroplastia ou uma gastro-jejunostomia.
Apesar de complicações como a diarreia, a vagotomia troncular continua a ser uma operação popular para a ulceração crónica devido à sua simplicidade. Está particularmente indicada nas seguintes situações
- cirrose, em que a rigidez do lobo esquerdo do fígado impossibilita a dissecção do hiato
- esplenectomia prévia: procedimentos alternativos de vagotomia podem dividir a artéria gástrica esquerda, resultando em um estômago proximal desvascularizado
- em situações de emergência, por exemplo, sangramento da artéria gastroduodenal - a simplicidade permite rapidez
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