Existem provavelmente múltiplos factores envolvidos na patogénese da síndrome da fibromialgia. No entanto, pensa-se que a perturbação do sono é de grande importância:
- há uma perda de sono não-REM
- uma síndrome semelhante à fibromialgia pode ser induzida em voluntários normais, privando-os do sono não-REM
A redução da aptidão aeróbica pode também ser importante.
Os sintomas afectivos estão associados à síndrome da fibromialgia, mas não se sabe se são primários ou secundários.
Uma causa viral para a síndrome da fibromialgia não é apoiada por qualquer evidência.
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