- atravessado pelo aqueduto que une o terceiro e o quarto ventrículos
- núcleos dos nervos cranianos:
- nervo oculomotor e núcleos de Edinger - Westphal - ao nível do colículo superior; o terceiro nervo emerge da face ventral do mesencéfalo (entre os pedúnculos cerebrais)
- nervo troclear - ao nível do colículo inferior; emerge dorsalmente
- outras relações no mesencéfalo:
- núcleo vermelho - no mesencéfalo, ao nível dos colículos superiores
- substantia nigra - situa-se imediatamente atrás dos pedúnculos cerebrais do mesencéfalo
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