A degradação das proteínas é dependente da energia e ocorre em duas condições:
- fisiologicamente:
- como forma de destruir as proteínas que se formaram de forma anormal
- como forma de reduzir as concentrações de enzimas, alterando assim o fluxo através das vias metabólicas
- no interior das células sujeitas a enzimas digestivas
- patologicamente, por exemplo, durante uma inanição prolongada
No interior das células, a degradação das proteínas pode ocorrer
- nos lisossomas:
- particularmente no fígado
- contêm proteinases abundantes
- nos reticulócitos: contêm proteases citosólicas
- no músculo:
- peptidases activadas pelo cálcio
- degradam as proteínas miofibrilares
Os aminoácidos assim produzidos ficam então disponíveis para as vias normais do metabolismo dos aminoácidos.
Pouco se sabe sobre o controlo geral da degradação das proteínas, mas a regulação do músculo esquelético está melhor caracterizada:
- as hormonas anabólicas, como a insulina, diminuem a degradação proteica
- os glucocorticóides e a tiroxina têm o efeito inverso
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