Estes incluem:
- hemorragia, revertida com sulfato de protamina
- trombocitopenia - esta deve-se a um efeito direto da heparina nas plaquetas, que geralmente melhora com a interrupção da heparina. Parece existir também um mecanismo imunitário que ocorre 6-12 dias após o início da terapêutica com heparina. Esta última causa de trombocitopenia através da agregação imunomediada das plaquetas associada à heparina pode predispor à formação de trombos plaquetários e à coagulação intravascular disseminada, para além da trombocitopenia.
- outros efeitos secundários incluem alopécia e osteoporose
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