Las causas no infecciosas de diarrea tienden a provocar una diarrea más crónica. Las causas incluyen:
- intolerancia a los monosacáridos
- intolerancia a los disacáridos
- intolerancia a la leche de vaca
- enfermedad celíaca
- colitis ulcerosa y enfermedad de Crohn
- fibrosis quística
- agammaglobulinemia
- acrodermatitis enteropática - carencia de zinc
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