Des déficiences du système immunitaire et des défenses physiques de l'hôte peuvent être à l'origine de la bronchectasie :
- déficit primaire et secondaire en immunoglobulines
- déficit en complément
- déficit en phagocytes
- maladie granulomateuse chronique
- maladie de Chediak-Higashi
- déficit d'adhérence des leucocytes
- l'aspergillose broncho-pulmonaire allergique
- post-transplantation pulmonaire
- le syndrome des cils immobiles
- le syndrome de Kartagener
- syndrome de Young
- fibrose kystique
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