L'intolérance au lactose peut résulter de presque n'importe quel trouble provoquant une lésion des muqueuses avec épuisement de la lactase entérique.
Les causes possibles sont les suivantes
- diarrhée post-infectieuse
- maladie inflammatoire de l'intestin
- intolérance aux protéines du lait de vache
- les états d'immunodéficience
- prolifération bactérienne secondaire à une anomalie anatomique
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