L'agammaglobulinémie de Bruton se caractérise par une fonction immunitaire normale pendant les six premiers mois, probablement en raison de la présence d'anticorps maternels, suivie d'infections bactériennes récurrentes dues principalement aux staphylocoques et à l'Haemophilus influenzae.
La furonculose, la pneumonie et la méningite récurrentes sont typiques. Il peut également y avoir une sinusite chronique, une bronchectasie et une maladie auto-immune du tissu conjonctif telle qu'une arthrite de type rhumatoïde qui tend à affecter les grosses articulations.
La sensibilité à la plupart des infections fongiques et virales est normale, à l'exception des virus de l'hépatite, des entérovirus, de l'échovirus - qui provoque une encéphalite mortelle - et du poliovirus associé au vaccin - qui provoque une paralysie.
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