Os cofactores são iões e, menos frequentemente, moléculas, que estão fortemente ligados a uma enzima e, normalmente, situados no local ativo. Geralmente, funcionam como aceitadores e dadores de electrões. São vitais para o funcionamento da enzima. Os exemplos incluem:
- Fe 2+/Fe 3+ na citocromo oxidase
- Zn2+ na carboxipeptidase A
- Cl- na amilase
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