Man geht davon aus, dass Enzyme durch die Verringerung der Aktivierungsenergie für eine bestimmte Gleichgewichtsreaktion wirken. Dies kann durch die Bildung eines Zwischenstufen-Komplexes zwischen Enzym und Substrat geschehen. Die Enzymkinetik befasst sich mit der Art und Weise, wie enzymkatalysierte Reaktionen durch Variationen von Variablen verändert werden, wie z. B:
Einige Reaktionen gehorchen nicht den normalen kinetischen Phänomenen; die Bindung eines Substrats an einer Stelle kann die Bindung eines weiteren Substrats an einer zweiten Stelle desselben Enzyms verändern. Dabei handelt es sich um eine allosterische Wechselwirkung, die zu einer Kooperativität führt - eine aktive Stelle moduliert die Funktion einer anderen und erhöht in der Regel deren Empfindlichkeit.
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