Nicht infektiöse Ursachen für Durchfall führen eher zu einer chronischen Diarrhö. Zu den Ursachen gehören:
- Monosaccharid-Intoleranz
- Disaccharid-Unverträglichkeit
- Kuhmilchunverträglichkeit
- Zöliakie
- Colitis ulcerosa und Morbus Crohn
- Mukoviszidose
- Agammaglobulinämie
- Acrodermatitis enteropathica - Zinkmangel
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