Un tableau clinique similaire peut être observé dans les circonstances suivantes :
- infection à campylobacter
- shigellose
- intoxication alimentaire de type toxine :
- Staphylococcus aureus
- Clostridium perfringens
- Bacillus cereus (l'intoxication alimentaire à médiation toxinique se manifeste généralement après moins de 6 heures)
- les maladies inflammatoires de l'intestin :
- il peut être difficile de distinguer une colite primaire aiguë à Salmonella d'un épisode de maladie inflammatoire de l'intestin
- une maladie inflammatoire de l'intestin est évoquée si une diarrhée sanglante persiste au-delà de 2 semaines malgré un traitement antibiotique approprié
- une biopsie rectale avec histologie peut être utile
- un essai de stéroïdes peut également s'avérer approprié.
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