La cystinose est la cause la plus fréquente chez les enfants. Cependant, toute forme d'atteinte tubulaire rénale peut être responsable, par exemple :
Remarque : le syndrome de Fanconi idiopathique peut survenir :
Il convient de noter qu'un syndrome de Fanconi associé à un dysfonctionnement hépatique suggère une maladie de Wilsons, une tyrosinémie ou une galactosémie.
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