As causas endócrinas incluem:
- uraemia
- tirotoxicose
- síndrome carcinoide
- síndroma de Zollinger-Ellison
- carcinoma medular da tiroide
- hipoparatiroidismo
- diabetes mellitus, que pode causar neuropatia autonómica diabética, com diarreia nocturna
- síndroma de Verner-Morrison
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