Otros trastornos autoinmunes asociados a la enfermedad son:
- lupus eritematoso sistémico
- artritis reumatoide
- anemia perniciosa
- vitíligo
- diabetes mellitus de tipo I - también algunas formas de diabetes de tipo II como la LADA (diabetes autoinmune latente de la edad adulta)
- enfermedad de Grave
- Síndrome de Turner: las mujeres con síndrome de Turner tienen una incidencia mucho mayor de tiroiditis autoinmune que la población general.
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