Os defeitos no sistema imunitário e nas defesas físicas do hospedeiro podem causar bronquiectasias, incluindo:
- deficiência primária e secundária de imunoglobulinas
- deficiência de complemento
- défices de fagócitos
- doença granulomatosa crónica
- doença de Chediak-Higashi
- défice de aderência dos leucócitos
- aspergilose broncopulmonar alérgica
- pós-transplante pulmonar
- síndrome dos cílios imóveis
- Síndrome de Kartagener
- síndroma de Young
- fibrose cística
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